تتبع مساعد رئيس المركز، وتتكون من الدوائر التالية:وتمارس المهام والاختصاصات التالية فيما يتعلق بعمل المؤسسات التعليمية التابعة للمركز:
دائرة شؤون معاهد العلوم الاسلامية
مكتب شؤون مدارس القرآن الكريم
معاهد العلوم الإسلامية
تنفيذ الأوامر والقرارات التي يتلقاها مركز السلطان قابوس للثقافة الإسلامية بشأن إنشاء المؤسسات التعليمية وتشغيلها وتوفير الخدمات التعليمية بها.
ممارسة الإشراف التربوي (الإداري والفني) على سير العمل، وتحديد أساليب تقييم الأداء بها، ومساعدتها على تحقيق الأهداف المرسومة لها.
متابعة أداء مديري المؤسسات التعليمية وأعضاء الهيئات التدريسية بها واقتراح أساليب تطويرها.
اقتراح اللوائح التنظيمية والسياسات التشغيلية للمؤسسات التعليمية.
الإشراف على تقويم أداء الطلاب والأنشطة التي يمارسونها.
التنسيق مع وزارة التربية والتعليم فيما يتعلق بامتحانات طلاب الصف الثاني عشر.
اقتراح الخطط والاستراتيجيات المستقبلية للمناهج الخاصة في المركز لتتوافق مع أهداف التعليم في السلطنة وأهداف وغايات المركز وكذلك حاجة المجتمع ومتطلبات سوق العمل.
التنسيق مع الإدارات والدوائر والمكاتب في المركز لتحديد الاحتياجات التدريبية والتأهيلية لمنتسبيها، ووضع الخطط اللازمة لتنفيذها بالتنسيق مع الجهات المختصة الأخرى.
دائرة شؤون معاهد العلوم الإسلامية
دائرة شؤون معاهد العلوم الإسلامية
دائرة شؤون معاهد العلوم الإسلامية
دائرة شؤون معاهد العلوم الإسلامية
مكتب شؤون مدارس القرآن الكريم
مكتب شؤون مدارس القرآن الكريم
مكتب شؤون مدارس القرآن الكريم
مكتب شؤون مدارس القرآن الكريم
تسعى معاهد العلوم الإسلامية إلى تحقيق جملة من الأهداف منها:
ترسيخ المبادئ والقيم الإسلامية لدى المتعلمين وربطهم بحضارة أمتهم.
إعداد فئة من المتعلمين المجيدين في العلوم الإسلامية واللغة العربية.
تزويد المتعلمين بقدر مناسب من المواد والمهارات العلمية الحديثة.
تنمية روح الوطنية في نفوس المتعلمين ووصلهم بتراث وطنهم.
تهيئة مخرجات مؤهلة لمواصلة التعليم العالي.
تلبية حاجة المجتمع من الكفاءات المؤهلة في المجالات المتصلة بدراستهم.
تحقيق التكامل في شخصية المتعلم روحياً وعقلياً ونفسياً واجتماعياً وجسمياً.
الموقع الجغرافي لإدارة الشؤون التعليمية
معاهد العلوم الإسلامية
مدارس القرآن الكريم
معهد السلطان قابوس لتعليم اللغة العربية للناطقين بغيرها